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2023年12月22日 星期五

GluD1:一個可與GABA結合的穀胺酸受體

 

GABA的3D分子模型。圖片來源:維基百科

一般來說,大腦中的大部分興奮性神經傳導是由離子型穀胺酸受體(iGluR)家族成員負責的。它們是一類重要的膜蛋白,具有以下特性:

1. iGluRs屬於穀胺酸受體的一種,穀胺酸是哺乳動物中主要的興奮性神經傳導物質。
2. 這些受體是配體門控型離子通道,當穀胺酸(配體)與受體結合時,會引起通道開啟,允許特定的離子(如鈉、鉀和鈣)流過細胞膜。
3.iGluRs有三大類亞型,分別是AMPA受體(α-氨基-3-羥基-5-甲基-4-異恐呼噁唑丙酸受體)、NMDA受體(N-甲基-D-天冬氨酸受體)和kainate受體。
4. iGluRs在神經傳導、神經可塑性、學習與記憶形成中扮演關鍵角色。NMDA受體於其在長期增強(LTP)中的作用特別著名,這是一種與學習和記憶關聯的突觸可塑性形式。
5. iGluRs的功能可以通過多種機制調節,包括磷酸化、蛋白質交互作用和基因表達調控。
6. iGluRs異常與多種神經退行性疾病(如阿茲海默症、帕金森症)、精神疾病(如抑鬱症、精神分裂症)和其他神經系統疾病相關。

這些特性使iGluRs成為神經科學研究的重要對象,並為開發針對神經相關疾病的治療方法提供了可能的途徑。

然而,GluD1作為這個家族的成員之一,其功能和特性卻與傳統iGluRs有所不同。

GluD1,全名為穀胺酸去極化受體1(Glutamate Delta-1 Receptor),是屬於離子型穀胺酸受體(iGluR)家族的一員。這個家族的受體在神經系統中扮演著關鍵角色,主要負責傳遞興奮性信號。

在先前的研究中,GluD1被認為與傳統的iGluR功能不同,它對穀胺酸不敏感且不直接參與典型的離子通道活動。而且,它存在於興奮性和抑制性突觸中;更特別的是,在小鼠海馬體的stratum lacunosum-moleculare (SLM) 區域,GluD1受體主要累積在抑制性突觸而非興奮性突觸。這使得GluD1在iGluR家族中顯得有些異常,引起了研究團隊進一步的興趣和研究。

在論文中,研究團隊採用了幾種方法來證明GluD1受體可以與GABA結合:

1. 電生理實驗:通過使用細胞外紀錄技術,研究人員測量了GABA對GluD1表達細胞的影響。他們觀察到在這些細胞中,GABA的應用會引起特定的電流變化,這表明GABA與GluD1受體的直接交互作用。
2. 藥理學方法:利用特定的藥物,可以抑制或增強GABA的效果,進一步支持了GABA和GluD1之間的相互作用。例如,使用GABA受體拮抗劑可以阻止GABA引起的電流變化。
3. 分子生物學實驗:作者可能進行了突變實驗,改變GluD1受體的特定胺基酸,以確定哪些部分對GABA的結合非常重要。這些實驗有助於確定GABA與GluD1結合的具體分子機制。
作者首先在GluD1受體中引入了“Lurcher” A654T突變(Ala654→Thr),這是一種使GluD2受體持續活化的突變。這種GluD1-A654T突變體在表現在非洲爪蟾卵母細胞(Xenopus oocytes)後,產生了小但可靠的持續內流電流。隨後,為了增強這些電流,作者又引入了另一個突變C645I(Cys645→Ile),使之與GluD2的M3孔道段匹配。這個雙重突變體(GluD1-A654T-C645I),被稱為GluD1-Lurcher,產生了更大的持續電流,並且這些電流可以被D-絲胺酸和甘胺酸增強。
另外,研究團隊在GluD1受體的配體結合域(LBD)上進行的突變實驗顯示,當這些位點突變後,對GABA的反應完全消失,這現使GluD1 LBD在感知GABA方面起著主要作用。
研究團隊還用了非Lurcher的GluD1突變體來研究GABA的結合和引起的構象變化。這些實驗顯示,GABA能夠與GluD1結合並引起結構上的變化。此外,當GluD1受體無法與配體結合時,未檢測到任何螢光信號,這表明在GluD1 LBD上的配體結合是關鍵的分子事件。
4. 結構生物學分析:利用X射線晶體學或冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)技術來解析GluD1受體的三維結構,並觀察GABA結合時的結構變化。這可以提供直接的結構證據表明GABA與GluD1受體的交互作用。
5. 生化實驗:使用標記的GABA或其他生化方法來直接證明GABA與GluD1受體的物理結合。研究團隊應用了一種稱為螢光共振能量轉移(FRET)的技術,來觀察GABA和GluD1之間的物理接觸和相互作用。
在螢光共振能量轉移實驗中,當GABA(作為配體)接近GluD1受體時,會引起螢光分子之間的能量轉移,從而發出可檢測的信號。這種信號顯示GABA已經與GluD1受體緊密結合。該方法提供了直接的實驗證據,支持GABA能夠與GluD1受體發生特異性的分子交互作用。
這些方法的結合使用為GluD1受體與GABA之間的交互作用提供了強有力的證據,從而改變了我們對於神經遞質受體交互作用的理解。

過去並不認為iGluRs(離子型穀胺酸受體)會與GABA(γ-氨基丁酸)結合。iGluRs通常被認為是專門響應穀胺酸的受體,而GABA是一種不同的神經傳導物質,主要在大腦中產生抑制性作用。穀胺酸和GABA的受體在功能和結構上被認為是相互獨立的。

穀氨酸作為主要的興奮性神經傳導物質,其受體iGluRs主要參與神經活動的促進和調節。相反,GABA是主要的抑制性神經傳導物質,其受體(例如GABA_A和GABA_B受體)主要參與減少神經活動和促進鎮靜。

發現穀胺酸受體GluD1會與GABA結合,為神經科學研究開啟了一個新的視野。這個研究成果挑戰了關於穀胺酸和GABA受體之間的傳統二分法,並為理解神經抑制性可塑性的機制提供了新的見解。這項發現對於神經科學和精神疾病的研究具有重要意義,因為GluD1突變與自閉症、精神分裂症和重度憂鬱症的易感性有關。

參考文獻:

Laura Piot et al. ,GluD1 binds GABA and controls inhibitory plasticity. Science 382, 1389-1394(2023). DOI:10.1126/science.adf3406

2016年7月31日 星期日

穀胺酸(glutamic acid)與小麥(wheat)

穀氨酸。圖片來源:Wiki

穀胺酸(glutamic acid)是在 1866由德國化學家 Karl Heinrich Ritthausen(1826-1912)用硫酸(sulfuric acid)處理麵筋  (wheat gluten,法文與拉丁文都寫作gluten;原意是黏膠)後得到的。因此,它被命名為 glutamic acid。而中文譯名穀胺酸,應該也是因為這個胺基酸是由穀物得到的。

雖然是非必需胺基酸(也就是說我們自己可以合成),穀氨酸在代謝上非常重要,透過轉胺反應(transamination),穀胺酸可以變成α-酮戊二酸(α-ketoglutarate),而跟穀胺酸一起進行轉氨反應的分子,如果是丙酮酸則會生成丙胺酸(alanine),若是草酰乙酸(oxaloacetate)則生成天冬胺酸(aspartate),這些胺基酸也都是對我們很重要的化合物喔!

除此之外,穀胺酸也是脊椎動物很重要的神經傳導物質,它有興奮的效果;所以穀胺酸也是腦中含量最高的分子之一。由穀胺酸還可以合成有抑制作用的 γ-胺基丁酸(gamma-aminobutyric acid,GABA)。

穀胺酸也是植物氮同化吸收路徑(nitrogen assimilation)中的重要成員。植物可以銨(ammonium)或硝酸根(nitrate)的形式吸收氮,進入體內後先轉為銨,再經過穀胺醯胺合成酶(glutamine synthetase,GS)與穀胺酸合成酶(glutamate synthase,GOGAT)將銨的氮轉入碳骨架,產生穀胺酸。穀胺酸接著還會經過天門冬醯胺合成酶(asparagin synthetase,AS)產生天門冬醯胺(asparagine),用以運輸或儲存。由於銨會擾亂粒線體的氫離子濃度梯度,影響電子傳遞鏈運作,所以只要一生成銨就會很快的轉為穀胺酸。因此,穀胺酸與穀胺醯胺加起來,可是地球上含量最高的胺基酸呢!

穀胺酸最為人所知的大概就是味精(穀胺酸鈉,monosodium glutamate)了。1908年東京帝國大學(Tokyo Imperial University)的池田菊苗(Kikunae Ikeda)博士,將昆布湯蒸發後得到棕色的結晶。當他用舌頭去嚐嚐這結晶時,他發現在很多食物(尤其是海草)裡面都嚐過這味道。池田博士將這個味道命名為「鮮味」(unami),並將製造這個結晶的方法申請專利;這個結晶就是味精。

參考資料:

Wikipedia. glutamic acid.

Moura A, Savageau MA, Alves R (2013) Relative Amino Acid Composition Signatures of Organisms and Environments. PLoS ONE 8(10): e77319. doi:10.1371/journal.pone.0077319

2014年8月29日 星期五

嚴重酒精成癮與神經傳導物質GABA有關

過去的許多研究已經發現,並不是每個人都對成癮性物質(如煙、酒、毒品)有興趣。有的人接觸一次以後就敬謝不敏,有的人則不僅是「一試成主顧」,而且還欲罷不能。由於人們在對於成癮性物質的反應差距如此之大,因此科學家們一直認為,酒精成癮--尤其是嚴重的酒精成癮--一定跟遺傳有關;而到目前為止,也找到了幾個基因,但是這些基因如何操控酒精成癮的機制,仍然不清楚。

圖片來源:維基百科

最近,在美國Scripps研究所的研究團隊發現,有一個基因Nf1 (neurofibromatosis type 1),與酒精成癮有關。研究結果顯示,Nf1透過調整γ-氨基丁酸(GABA,gamma-aminobutyric acid)的分泌,使個體在初次接觸酒精之後的重複接觸,是否會漸次地提高飲用酒精的量;而這個行為與酒精成癮相關。

研究團隊使用部分剔除Nf1的小鼠,來測試接觸酒精之後的行為。結果發現,部分剔除Nf1的小鼠,在飲酒之後,中央杏仁核(central amygdala)的GABA濃度並未上昇,而過後這些小鼠對於酒精也並不特別感興趣。

相對的是,表現正常量的Nf1的小鼠,在飲酒之後,中央杏仁核的GABA濃度上昇,而當研究人員重複給予酒精時,這些小鼠的飲酒量也漸次增加。

研究團隊在檢視人類的Nf1基因時,也在9,000個人裡面發現,人類對酒精成癮的行為,似乎也跟Nf1基因相關。

但是,在小鼠的實驗中,野生種(即未剔除Nf1基因的小鼠)會對酒精成癮,這部分跟人的成癮性行為要怎麼解釋呢?若以小鼠的例子看來,似乎人人都可以成為酒鬼;但是以人來說,只有5%的人視酒如命,另外12%的人經常飲酒,而其他的人並不常喝酒,或根本滴酒不沾。所以,Nf1在小鼠上的結果,是否能用來解釋人類的成癮性行為,這就有待後續研究了。

參考文獻:

2014/8/27. Alcohol-dependence gene linked to neurotransmitter. Science Daily.