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2016年8月17日 星期三

從母雞的尿裡面找到的鳥胺酸(ornithine)

鳥胺酸。圖片來源:Wiki
鳥胺酸是由M. Jaffe在1877年從吃了苯甲酸(benzoic acid)的母雞的尿裡面,以鳥尿酸的形式(ornithuric acid,鳥胺酸的氧化)分離出來的。它的結構在1901年由埃米爾·菲舍爾(Emil Fischer,1852–1919)經過化學合成確認。應該是因為從母雞裡面分離出來,所以用了希臘文的鳥(ornithos)來命名。

鳥胺酸與瓜胺酸(citrulline)一樣,是尿素循環(urea cycle)的產物之一。我們用尿素循環將體內的氨轉變為尿素,然後再排出體外。在尿素循環的最後一個反應裡,精胺酸(arginine)被精胺酸酶(arginase)水解,產生鳥胺酸與尿素。然後鳥胺酸被回收,而尿素則排出體外。

參考資料:

Guoyao Wu. 2013. Amino Acids: biochemistry and nutrition. CRC press. ISBN 978-1-4398-6189-9

Wikipedia. Ornithine. Arginase.

Bioetymology. Ornithine.

瓜胺酸(citrulline)與西瓜(watermelon)

瓜胺酸。圖片來源:Wiki

瓜胺酸(citrulline)的名稱來自西瓜(watermelon),因為它是由Koga 與 Odake首先在1914年從西瓜裡面分離出來的。到了1930年,M. Wada再次確認,因此就用了拉丁文的西瓜「citrullus」給瓜胺酸命名了。

瓜胺酸雖然不是必需胺基酸,也不是標準蛋白質胺基酸,但是它是肝臟中的尿素循環(urea cycle)的中間產物,而尿素循環是很重要的代謝途徑。我們經由尿素循環將體內的氨轉變為尿素,然後再排出體外。除此之外,瓜胺酸可以由精胺酸(arginine)產生;精胺酸被一氧化氮合酶(nitric oxide synthase)分解,產生瓜胺酸與一氧化氮(nitric oxide,NO)。這個反應是細胞用來產生一氧化氮、使血管擴張的重要反應。

2 L-arginine + 3 NADPH + 1 H+ + 4 O2 <-->  2 citrulline +2 nitric oxide + 4 H2O + 3 NADP+

有些蛋白質(如組蛋白histone)含有瓜胺酸,但是這些瓜胺酸是在轉譯(translation)完成後再經過精氨酸脫亞胺酶(peptidylarginine deiminases,PADs)將精胺酸瓜氨酸化(citrullination,或稱為脫亞胺化deimination)而產生的。類風濕性關節炎(rheumatic arthritis)的患者常可測到抗瓜胺酸抗體,雖然不知道為何會產生,但因為常可以偵測到,所以已經成為這個疾病的診斷標準之一了。

參考資料:

Wikipedia. Citrulline.

Guoyao Wu. 2013. Amino Acids: biochemistry and nutrition. CRC press. ISBN 978-1-4398-6189-9

2016年7月29日 星期五

精胺酸(arginine)

精氨酸。圖片來源:Wiki

精氨酸的英文名稱是arginine,這個字是從希臘文argiros來的,意思是「銀白色的金屬」。

氨基酸與銀白色的金屬有什麼關係呢?原來,精氨酸是在1886年由瑞士的化學家Ernst Schulze與E. Steiger從羽扇豆(Lupin)的白化苗中萃取出來的。由於精氨酸的硝酸鹽(arginine nitrate)是銀白色的,所以Shulze就將這個氨基酸取名為arginine。

Arginine nitrate。圖片來源:BTRWORlds

至於為什麼arginine的中文名字是精氨酸,有兩種說法。一種說法是:因為精液中80%由精胺酸構成,所以稱之為精胺酸;另有一說因為精蛋白(protamine)含有很多arginine,所以arginine被命名為精氨酸。前一種說法,經過查證應該是不可信(精液中含量最多的是果糖),第二種說法比較有可能。

在某些蛋白質上的精氨酸,其支鏈的氮原子會被醣化(glycosylation),稱為N-linked glycosylation,對於個別蛋白質的構造與功能非常重要。除了它以外,絲氨酸(serine)蘇氨酸(threonine)是另外兩個會被醣化的氨基酸,不過它們醣化的位置在支鏈的羥基(hydroxyl group)上,稱為O-linked glycosylation。

在細胞中精胺酸有個很重要的反應:產生一氧化氮(nitric oxide,NO)。一氧化氮是重要的血管擴張因子。在這個反應中,精胺酸被一氧化氮合酶(nitric oxide synthase)分解,產生瓜胺酸(citrulline)與一氧化氮。這個反應是細胞用來產生一氧化氮、使血管擴張的重要反應。

2 L-arginine + 3 NADPH + 1 H+ + 4 O2 ←→2 citrulline +2 nitric oxide + 4 H2O + 3 NADP+

精胺酸是尿素循環(urea cycle)的一部份。我們用尿素循環將體內的氨轉變為尿素,然後再排出體外。在尿素循環的最後一個反應裡,精胺酸被精胺酸酶(arginase)水解,產生鳥胺酸(ornithine)與尿素。然後鳥胺酸被回收,而尿素則排出體外。

參考文獻:

Wikipedia. Arginine. Protamine. Semen.

ZZ 20種氨基酸的命名來源。百度貼吧:生物吧。

Bioetymology. Arginine

Guoyao Wu. 2013. Amino Acids: biochemistry and nutrition. CRC press. ISBN 978-1-4398-6189-9