2016年8月18日 星期四

從葡萄乾來的葡萄糖(glucose)

葡萄糖。圖片來源:Wiki

葡萄糖 (glucose)英文名稱其實就是「甜的糖」的意思,因為字首 gluc(o)- 源自希臘文 glykys,意為「甜」(sweet);gluc(o)- 也可以寫作 glyc(o)-,而字尾-ose就是糖的意思。

第一個發現葡萄糖的人是德國的化學家馬格列夫 (Andreas Marggraf ,1709-1782),他在1747年從葡萄乾(raisins)裡面分離出葡萄糖;所以葡萄糖有個俗稱叫做 grape sugar。「葡萄糖」(glucose)這個名稱是在1838年由法國化學家讓 - 巴蒂斯特·杜馬(Jean-Baptiste Dumas,1800-1884)取的。而葡萄糖的結構則是由德國化學家埃米爾·菲舍爾(Emil Fischer,1852–1919)定出來的,他因為對糖的結構的研究,得了1902年的諾貝爾化學獎(其實他對胺基酸的研究貢獻也很大)。

不論是好氧(aerobic)或厭氧(anaerobic)的生物,都需要葡萄糖作為主要的能量來源。我們的大腦、胚胎組織更是完完全全的依賴葡萄糖!因此,生物發展出不同的儲存葡萄糖的形式;動物與微生物儲存肝醣(glycogen),植物儲存澱粉(starch)與蔗糖(sucrose)。肝醣與澱粉全部都由葡萄糖組成,蔗糖則有一半是葡萄糖,另一半是果糖(fructose)。哺乳動物主要運輸的碳水化合物就是葡萄糖,而植物主要運輸的碳水化合物是蔗糖,其中也有一半是葡萄糖;昆蟲運輸的是海藻糖(trehalose),是由葡萄糖構成不具有還原力的雙糖。由於葡萄糖有還原力,使得糖尿病(diabetes)的病人若血糖控制不佳,當血糖(也就是葡萄糖)濃度高時,會開始還原細胞膜上的脂質、蛋白質等,對細胞造成損害;長久下來,如腎臟等器官就會出現問題。

除此了能量的用途之外,植物的細胞壁主要由纖維素(cellulose)構成,而纖維素也是葡萄糖;昆蟲與甲殼類會合成幾丁質(chitin,一名甲殼素),而幾丁質是葡萄糖的衍生物 N-乙酰葡萄糖胺(N-acetylglucosamine)所構成的聚合物。哺乳動物在授乳時期,雌性動物的乳腺會製造乳糖(lactose),乳糖也有一半是葡萄糖(另一半是半乳糖 galactose)。

葡萄糖還可以用來合成維生素C(vitamin C,ascorbic acid),不過人類因為少了中間的某些酵素,所以無法合成,一定要從飲食中取得。由於維生素C主要出現在蔬菜水果中,造成在十六世紀的地理大發現時,遠洋航行常常伴隨著因維生素C不足導致的壞血症(scurvy),後來發現只要帶著檸檬(汁),就可以避免這個問題。

參考資料:

Bioetymology. Glucose.

Wikipedia. Glucose.

Nobel Prizes and Laureates. Emil Fischer - Facts. Nobelprize.org.

2016年8月17日 星期三

氧(oxygen)與「酸」(acid)

元素「氧」的英文是 oxygen,字首是 ox-, oxy-。但是「酸」(sharp, sour, acid)的字首,也是一樣的。為什麼會這樣呢?


拉瓦節。圖片來源:wiki
氧氣是拉瓦節(Antoine Lavoisier,1743-1794)命名的。他透過進行了一連串精巧的實驗,推翻了當時所謂的「燃素」(phlogisticated air)理論。

在1778年,拉瓦節向法國科學院發表了有關燃燒的實驗。在他的文章中,他提到所謂的「燃素」(phlogisticated air)其實並不存在,而是因為這些金屬--如他實驗中的磷、硫、錫、汞等--吸收了空氣中的一種成分。這種成分,可以由加熱氧化汞(red calx,即HgO,俗稱三仙丹)得到。

由於這些金屬的氧化物都具有酸性,所以拉瓦節認為,所有的「酸」裡面都有氧;於是他在1779年正式把被普利斯萊(Joseph Priestley,1733-1804)稱為「去燃素空氣」(dephlogisticated air)的成分命名為「氧氣」:oxygen。因為希臘文中的ox-或oxy-的意思是「酸」(oxys),而-gen則是「產生」的意思。

不過,拉瓦節在法國科學院的報告,招來了許多人的抱怨。包括普利斯萊以及舍勒(Carl Wilhelm Scheele,1742-1786),都在他之前曾經分離出氧氣,但是都沒有確認它是元素(感覺上舍勒錯過了不少東西)。不過,現在大家都還是認為,普利斯萊才是發現氧氣的人。

拉瓦節在法國大革命的恐怖統治時期(Reign of Terror)被捕,原因只是因為他擁有了農場(Ferme générale)向農民收租。當時他的夫人(Marie-Anne Paulze Lavoisier)努力的營救他,提出許多拉瓦節在科學上的重大貢獻,希望政府能讓他繼續他的研究;但是據說當時的法官的回答是:「共和國不需要科學家,也不需要化學家;但是正義不能被延遲!」(La République n'a pas besoin de savants ni de chimistes ; le cours de la justice ne peut être suspendu.(The Republic needs neither scientists nor chemists; the course of justice cannot be delayed.)),於是他在1794年的五月八日上了斷頭臺。

他去世以後,他的夫人努力保存他的筆記本、為他出書,使他在科學上的發現得以被保存與承認。許多他的筆記本,現在都在康乃爾大學(Cornell University)。

參考文獻:

George Johnson。2009。十項最美的實驗。 臉譜出版。

Wikipedia. Antoine Lavoisier, Joseph Priestley,Marie-Anne Paulze Lavoisier

氫(hydrogen)與水(water)

留意過字首與字尾的人一定會發現,代表氫的字首 hydr(o)-其實也可以用來代表水;而且氫的名稱 hydrogen意為「產生水的物質」。為什麼呢?

氫氣(hydrogen,H2)是由卡文迪什(Henry Cavendish,1731-1810)發現的,在1766年他將金屬片溶在強酸裡,產生的氣泡就是氫氣。雖然也有其他人比他先做這個實驗,但是他是第一個把這些氣體收集起來,發現氫氣可以燃燒的人。

卡文迪什收集氫氣的裝置。圖片來源:wiki
因為氫氣很容易燃燒,所以他把氫氣叫做「易燃空氣」(inflammable air)。「氫氣」(hydrogen)這個名字是拉瓦節(Antione Lavoisier,1743-1794)在1783年命名的,他重複了卡文迪什的實驗,而由於氫氣燃燒後產生水,所以拉瓦節為氫氣取名為hydrogen,是「水」hydr(o)-(希臘文hydor)與「產生」-gen的合體,意思就是「產生水的物質」。

卡文迪什也是二氧化碳的發現者:他將鹼溶在酸中,得到的氣泡就是二氧化碳。他醉心於科學,是個非常害羞的人,在科學上有非常大的貢獻。

參考資料:

Wikipedia. Henry Cavendish,Antione Lavoisier.

從母雞的尿裡面找到的鳥胺酸(ornithine)

鳥胺酸。圖片來源:Wiki
鳥胺酸是由M. Jaffe在1877年從吃了苯甲酸(benzoic acid)的母雞的尿裡面,以鳥尿酸的形式(ornithuric acid,鳥胺酸的氧化)分離出來的。它的結構在1901年由埃米爾·菲舍爾(Emil Fischer,1852–1919)經過化學合成確認。應該是因為從母雞裡面分離出來,所以用了希臘文的鳥(ornithos)來命名。

鳥胺酸與瓜胺酸(citrulline)一樣,是尿素循環(urea cycle)的產物之一。我們用尿素循環將體內的氨轉變為尿素,然後再排出體外。在尿素循環的最後一個反應裡,精胺酸(arginine)被精胺酸酶(arginase)水解,產生鳥胺酸與尿素。然後鳥胺酸被回收,而尿素則排出體外。

參考資料:

Guoyao Wu. 2013. Amino Acids: biochemistry and nutrition. CRC press. ISBN 978-1-4398-6189-9

Wikipedia. Ornithine. Arginase.

Bioetymology. Ornithine.

瓜胺酸(citrulline)與西瓜(watermelon)

瓜胺酸。圖片來源:Wiki

瓜胺酸(citrulline)的名稱來自西瓜(watermelon),因為它是由Koga 與 Odake首先在1914年從西瓜裡面分離出來的。到了1930年,M. Wada再次確認,因此就用了拉丁文的西瓜「citrullus」給瓜胺酸命名了。

瓜胺酸雖然不是必需胺基酸,也不是標準蛋白質胺基酸,但是它是肝臟中的尿素循環(urea cycle)的中間產物,而尿素循環是很重要的代謝途徑。我們經由尿素循環將體內的氨轉變為尿素,然後再排出體外。除此之外,瓜胺酸可以由精胺酸(arginine)產生;精胺酸被一氧化氮合酶(nitric oxide synthase)分解,產生瓜胺酸與一氧化氮(nitric oxide,NO)。這個反應是細胞用來產生一氧化氮、使血管擴張的重要反應。

2 L-arginine + 3 NADPH + 1 H+ + 4 O2 <-->  2 citrulline +2 nitric oxide + 4 H2O + 3 NADP+

有些蛋白質(如組蛋白histone)含有瓜胺酸,但是這些瓜胺酸是在轉譯(translation)完成後再經過精氨酸脫亞胺酶(peptidylarginine deiminases,PADs)將精胺酸瓜氨酸化(citrullination,或稱為脫亞胺化deimination)而產生的。類風濕性關節炎(rheumatic arthritis)的患者常可測到抗瓜胺酸抗體,雖然不知道為何會產生,但因為常可以偵測到,所以已經成為這個疾病的診斷標準之一了。

參考資料:

Wikipedia. Citrulline.

Guoyao Wu. 2013. Amino Acids: biochemistry and nutrition. CRC press. ISBN 978-1-4398-6189-9

2016年8月16日 星期二

苯基(phenyl)

酚。圖片來源:wiki

帶有苯環(benzene)的化合物都會以phen(o)- 或 phenyl- 來表示(如苯丙胺酸 phenylalanine),但是 phenol 其實是酚。

酚是由德國分析化學家弗里德里希·費迪南·龍格(Friedlieb Ferdinand Runge,1795-1867)在1834年由煤焦油(coal tar)中提煉出來。當時龍格把它稱為「Karbolsäure」,意為「煤油酸」。不過那時後提煉出來的酚純度並不高。

真正把酚純化出來的人是法國的奧古斯特·洛朗(Auguste Laurent),他在1841年得到純化的酚,也是他把酚命名為 phene,意思是「苯」(benzene)。七年後(1843),法國化學家查爾斯·弗雷德里克·格哈特(Charles Frédéric Gerhardt)把酚正式定名為 phenol。

在還沒有發現原油(petroleum)之前,酚都是從煤焦油裡面提煉出來的。酚是非常重要的工業原料,包括塑膠、尼龍、清潔劑、殺草劑以及藥品(最有名的就是阿斯匹靈 aspirin)的合成都需要酚,每年需要70億公斤。

參考資料:

Wikipedia. Phenol.

Online Etymology Dictionary. Phenol.

苯(benzene)與苯甲酸(benzoic acid)


苯甲酸。圖片來源:wiki

苯甲酸又名安息香酸,它的名字 benzoic acid是由安息香樹脂(benzoin resin)得來的。在1556年,諾斯特拉達姆士(Nostradamus)以安息香樹脂乾餾取得了苯甲酸。苯甲酸的名字就是這麼來的。

安息香樹脂。圖片來源:wiki

雖然這麼早就拿到苯甲酸,苯的發現卻幾乎要晚了三百年。第一個發現苯的人,是法拉第(Michael Faraday);在1825年,他從合成照明氣體(illuminating gas)後留下的油油的殘漬中分離出苯,但當時他沒有正式為它命名。到了1833年,米切利希(Eilhard Mitscherlich)這位德國化學家用苯甲酸與石灰(lime,氧化鈣)蒸餾得到苯。因為他從苯甲酸得到了苯,所以他用了 benzin 這個字來命名。轉成英文,就成了benzene。

苯甲酸除了是聲名狼籍的食品防腐劑以外,其實因為它可以抑制真菌、酵母菌、細菌的生長,在醫療上的用途也很多。例如香港腳(athlete's foot)的藥膏裡面就含有苯甲酸喔!苯甲酸作為防腐劑,一般用量是0.05%-0.1%,也就是每公斤0.5克到1克。它不可以使用在麵條中,最近(2015/10/2)高雄查獲的陽春麵條含有苯甲酸2.650g/kg,不但是違法使用,用量也已經遠超過許可在其他食物中的最大劑量了。

參考資料:

Wikipedia. Benzene.