2024年2月24日 星期六

細菌江湖:抗噬菌體(phage)的武林秘笈

 

圖片作者:ChatGPT

江湖在走,防身秘笈要有,否則就是任人魚肉。對細菌來說,這更是真理!

最近有個研究,以醫院中分離出來的具抗生素抗性的Pseudomonas aeruginosa為研究素材,研究它們對噬菌體的抗性。

研究團隊收集了28種噬菌體,用來測試他們從醫院裡分離到的32種具有抗生素抗性的菌。

他們發現,有68%的菌-噬菌體組合無法達成感染,在這些無法成功感染的組合中,有68%噬菌體有至少一半吸附到細菌表面。也就是說,不存在著因為細菌表面沒有接受器的原因。所以,可以說這些菌都有防禦系統。

這些細菌有多少「防身密技」呢?過去對這隻菌的研究已經知道,在目前已知的167套防禦系統中,這隻菌的不同菌株一共收藏了119套。必須要說,雖然還沒有到姑蘇慕容的境界,但也已經相當接近了。

收藏那麼多防身密技,當然不是有收藏癖;另外是,也不可能一隻菌收齊119套,就像大部分慕容家的人比較像慕容復而不是慕容博一樣,一隻細菌收集太多套「防身密技」就會對自己造成太大的負擔。研究團隊發現,有些組合可能是因為防身效果比較好,所以出現在同一隻菌裡面的機率比較高,如:

(i) Druantia Type III (Pbunavirus) and TerY-P (Autographiviridae)
(ii) Druantia Type III (Pbunavirus) and Zorya Type I (Autographiviridae, Bruynoghevirus, Casadabanvirus, and Fiersviridae)
(iii) Druantia Type III (Pbunavirus) and AVAST Type V (Phikzvirus)
(iv) AVAST Type V (Phikzvirus) and QatABCD (Casadabanvirus and Pbunavirus)
(v) AVAST Type V (Phikzvirus) and Zorya Type I (Autographiviridae, Bruynoghevirus, Casadabanvirus, and Fiersviridae)
(vi) TerY-P (Autographiviridae) with CBASS Type II (Casadabanvirus and Pbunavirus)

這六種組合是比較常見的。或許可以說,細菌學武功也是有派別的?只是不知道誰是少林、誰是武當?

當然,也有特別厲害的細菌,就像武林裡面有東邪、西毒、南帝、北丐、中神通一樣,在這個研究裡,竟然也有五隻「打遍天下無敵手」的菌,實驗裡面的所有噬菌體都無法感染他們。這五個傢伙是誰呢?

L0872、16-543324、16-547171、16-547181和Q0192。

這五個傢伙都是身負絕世武功,帶有13-19套防禦系統。而其中最厲害的,當然就是「中神通」:L0872,有19套防禦系統!跟只有四套的最弱的菌菌們比起來,真的是天與地啊!

那麼,對這隻菌來說,行走江湖到底需要有幾套密技防身呢?平均是10.66套。也就是說,不收集個十套,要走江湖恐怕會步履維艱吧。

想到這幾年開始流行的噬菌體療法,但是醫院裡已經有這種收集19套防禦系統的「中神通」細菌,不知道噬菌體療法還能發揮多久呢?

參考文獻:

Ana Rita Costa et al. ,Accumulation of defense systems in phage-resistant strains of Pseudomonas aeruginosa.Sci. Adv.10,eadj0341(2024).DOI:10.1126/sciadv.adj0341

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